Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 COQ6YGR255C 1440 nt5.64□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 ARE2YNR019W 1929 nt5.64□□□□□ -1.51 RIP-Chip
NOP56Q12460 TGL1YKL140W 1647 nt5.63□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 GCR2YNL199C 1605 nt5.63□□□□□ -1.51 RIP-Chip
NOP56Q12460 NRD1YNL251C 1728 nt5.63□□□□□ -1.51 RIP-Chip
NOP56Q12460 LUC7YDL087C 786 nt5.63□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 MSP1YGR028W 1089 nt5.63□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt5.63□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 MEH1YKR007W 555 nt5.63□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 VMA4YOR332W 702 nt5.63□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 GPI2YPL076W 843 nt5.63□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 YSA1YBR111C 696 nt5.63□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 MSC7YHR039C 1935 nt5.63□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 RET1YOR207C 3450 nt5.63□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 YDL114WYDL114W 927 nt5.62□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 YHR022CYHR022C 771 nt5.62□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 MHT1YLL062C 975 nt5.62□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.62□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 YPR015CYPR015C 744 nt5.62□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 AME1YBR211C 975 nt5.62□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 RPT2YDL007W 1314 nt5.62□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 VHS2YIL135C 1311 nt5.62□□□□□ -1.51 RIP-Chip
NOP56Q12460 ERG8YMR220W 1356 nt5.62□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 MCH1YDL054C 1461 nt5.62□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 IBA57YJR122W 1494 nt5.62□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 YEL077CYEL077C 3834 nt5.62□□□□□ -1.51 RIP-Chip
NOP56Q12460 SFI1YLL003W 2841 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 GPR1YDL035C 2886 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 YDR161WYDR161W 1164 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 RPL12AYEL054C 498 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 UBP9YER098W 2265 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 FAA3YIL009W 2085 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 RPE1YJL121C 717 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 LCB3YJL134W 1230 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 YLR326WYLR326W 723 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 GAS2YLR343W 1668 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 YIM2YMR151W 438 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 PCL1YNL289W 840 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 BUB3YOR026W 1026 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 RPL21AYBR191W 483 nt5.61□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 HIR1YBL008W 2523 nt5.6□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 CBP1YJL209W 1965 nt5.6□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 MPP10YJR002W 1782 nt5.6□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 PDC1YLR044C 1692 nt5.6□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 YDL026WYDL026W 312 nt5.6□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 RSM10YDR041W 612 nt5.6□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 RPL10YLR075W 666 nt5.6□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 DSC2YOL073C 969 nt5.6□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 BAP2YBR068C 1830 nt5.6□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 CUS1YMR240C 1311 nt5.59□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 GIP1YBR045C 1920 nt5.59□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 YDR222WYDR222W 1248 nt5.59□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 YDR282CYDR282C 1245 nt5.59□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 TIM21YGR033C 720 nt5.59□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 PRM9YAR031W 897 nt5.59□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 YLR346CYLR346C 306 nt5.59□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 KTR1YOR099W 1182 nt5.59□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 CSG2YBR036C 1233 nt5.59□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 RPN7YPR108W 1290 nt5.59□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 APL6YGR261C 2430 nt5.59□□□□□ -1.51
NOP56Q12460 UBP7YIL156W 3216 nt5.59□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 MLF3YNL074C 1359 nt5.58□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 CPS1YJL172W 1731 nt5.58□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 YDR053WYDR053W 396 nt5.58□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 IRC6YFR043C 714 nt5.58□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 WSS1YHR134W 810 nt5.58□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 POP5YAL033W 522 nt5.58□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 YLR036CYLR036C 612 nt5.58□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 MET16YPR167C 786 nt5.58□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 snR3snR3 194 nt5.58□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 IFM1YOL023W 2031 nt5.58□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 ARN1YHL040C 1884 nt5.58□□□□□ -1.52 RIP-Chip
NOP56Q12460 PHO90YJL198W 2646 nt5.58□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 SIF2YBR103W 1608 nt5.57□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 IMG1YCR046C 510 nt5.57□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 GET3YDL100C 1065 nt5.57□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 YJR084WYJR084W 1272 nt5.57□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 PAU17YLL025W 375 nt5.57□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 CTL1YMR180C 963 nt5.57□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 TIP20YGL145W 2106 nt5.57□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 ATH1YPR026W 3636 nt5.57□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 HFI1YPL254W 1467 nt5.57□□□□□ -1.52 RIP-Chip
NOP56Q12460 RAD57YDR004W 1383 nt5.56□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 PRR2YDL214C 2100 nt5.56□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 UIP5YKR044W 1332 nt5.56□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 GPD2YOL059W 1323 nt5.56□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 TRP4YDR354W 1143 nt5.56□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 OKP1YGR179C 1221 nt5.56□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 TSR2YLR435W 618 nt5.56□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 MRPS8YMR158W 468 nt5.56□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 SPS18YNL204C 903 nt5.56□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 PMA1YGL008C 2757 nt5.56□□□□□ -1.52 RIP-Chip
NOP56Q12460 ILV1YER086W 1731 nt5.56□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 DAL81YIR023W 2913 nt5.56□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 UTP7YER082C 1665 nt5.56□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 MCM3YEL032W 2916 nt5.55□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 GUA1YMR217W 1578 nt5.55□□□□□ -1.52
NOP56Q12460 YDR336WYDR336W 945 nt5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 393.5 ms