Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 SCS2YER120W 735 nt4.89□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 YHL049CYHL049C 816 nt4.89□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 NIT2YJL126W 924 nt4.89□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 MNN11YJL183W 1269 nt4.89□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 YJL211CYJL211C 444 nt4.89□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 CPR6YLR216C 1116 nt4.89□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt4.89□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 GRE1YPL223C 507 nt4.89□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 MRPL36YBR122C 534 nt4.89□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 ATG20YDL113C 1923 nt4.89□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 ULA1YPL003W 1389 nt4.89□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 APM4YOL062C 1476 nt4.88□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 MBP1YDL056W 2502 nt4.88□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 LHP1YDL051W 828 nt4.88□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 SLC1YDL052C 912 nt4.88□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 RPS16BYDL083C 432 nt4.88□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 MET31YPL038W 534 nt4.88□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 ECM2YBR065C 1095 nt4.88□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 MDR1YGR100W 2853 nt4.88□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 RRP9YPR137W 1722 nt4.88□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 ORC5YNL261W 1440 nt4.88□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 HXT7YDR342C 1713 nt4.87□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 HXT6YDR343C 1713 nt4.87□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 YCL065WYCL065W 369 nt4.87□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 YRA1YDR381W 681 nt4.87□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 YEL067CYEL067C 588 nt4.87□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 REC114YMR133W 1287 nt4.87□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 AAD15YOL165C 432 nt4.87□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 KAP114YGL241W 3015 nt4.87□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 APE1YKL103C 1545 nt4.87□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 HOT1YMR172W 2160 nt4.87□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 MPS3YJL019W 2049 nt4.86□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 SPL2YHR136C 447 nt4.86□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 ATG17YLR423C 1254 nt4.86□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 PRR1YKL116C 1557 nt4.86□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 THI20YOL055C 1656 nt4.86□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt4.85□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 CBT1YKL208W 816 nt4.85□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 ETT1YOR051C 1239 nt4.85□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 RPL21BYPL079W 483 nt4.85□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 YPL113CYPL113C 1191 nt4.85□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 snR19snR19 568 nt4.85□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 RPT1YKL145W 1404 nt4.85□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 FAA3YIL009W 2085 nt4.84□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 YHR045WYHR045W 1683 nt4.84□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 BRL1YHR036W 1416 nt4.84□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 UTR4YEL038W 684 nt4.84□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 YHR145CYHR145C 357 nt4.84□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 SEC13YLR208W 894 nt4.84□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 ROX3YBL093C 663 nt4.84□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 ETR1YBR026C 1143 nt4.84□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 MRI1YPR118W 1236 nt4.84□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 ATG12YBR217W 561 nt4.84□□□□□ -1.63
MSH5Q12175 CLA4YNL298W 2529 nt4.84□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 BLM10YFL007W 6432 nt4.84□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 GDB1YPR184W 4611 nt4.84□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 PEX7YDR142C 1128 nt4.83□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 YHR095WYHR095W 495 nt4.83□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 YMR245WYMR245W 621 nt4.83□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 BOP2YLR267W 1713 nt4.83□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 TRS23YDR246W 660 nt4.82□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 LYS5YGL154C 819 nt4.82□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.82□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 KRE9YJL174W 831 nt4.82□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 MAP2YBL091C 1266 nt4.82□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 MOT2YER068W 1764 nt4.82□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 HSP82YPL240C 2130 nt4.82□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 GIP1YBR045C 1920 nt4.82□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 SHM1YBR263W 1473 nt4.81□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 NOT3YIL038C 2511 nt4.81□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 ZUO1YGR285C 1302 nt4.81□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 KAR2YJL034W 2049 nt4.81□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 ASP1YDR321W 1146 nt4.81□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 YDR417CYDR417C 372 nt4.81□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 YOR111WYOR111W 699 nt4.81□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 VID22YLR373C 2706 nt4.81□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 GCN20YFR009W 2259 nt4.81□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 GAL4YPL248C 2646 nt4.81□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 STP4YDL048C 1473 nt4.81□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 FZO1YBR179C 2568 nt4.8□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 GIP2YER054C 1647 nt4.8□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 NUP116YMR047C 3342 nt4.8□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 SKI6YGR195W 741 nt4.8□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 YML018CYML018C 1182 nt4.8□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 YEF1YEL041W 1488 nt4.8□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 PRT1YOR361C 2292 nt4.8□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 YTA12YMR089C 2478 nt4.8□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 YPL260WYPL260W 1656 nt4.8□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 YPL245WYPL245W 1365 nt4.79□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 MRK1YDL079C 1506 nt4.79□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 TRX2YGR209C 315 nt4.79□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 CSR1YLR380W 1227 nt4.79□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 MNS1YJR131W 1650 nt4.79□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 MEC3YLR288C 1425 nt4.79□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 PAN1YIR006C 4443 nt4.78□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 RSM10YDR041W 612 nt4.78□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 PCT1YGR202C 1275 nt4.78□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 HAL1YPR005C 885 nt4.78□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 VBA2YBR293W 1425 nt4.78□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 SRV2YNL138W 1581 nt4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms