Protein–RNA interactions for Protein: Q09327

MGAT3, Beta-1,4-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT3Q09327 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MGAT3Q09327 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MGAT3Q09327 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MGAT3Q09327 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MGAT3Q09327 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MGAT3Q09327 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MGAT3Q09327 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MGAT3Q09327 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MGAT3Q09327 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MGAT3Q09327 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MGAT3Q09327 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MGAT3Q09327 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms