Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX8Q06710 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAX8Q06710 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX8Q06710 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms