Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARID5AQ03989 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID5AQ03989 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms