Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DSG1Q02413 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms