Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ROR1Q01973 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ROR1Q01973 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ROR1Q01973 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms