Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1BQ00975 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA1BQ00975 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA1BQ00975 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms