Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP1Q00587 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP1Q00587 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP1Q00587 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms