Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HDLBPQ00341 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDLBPQ00341 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms