Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD3P84022 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD3P84022 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms