Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP5P82980 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP5P82980 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP5P82980 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP5P82980 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP5P82980 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP5P82980 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP5P82980 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP5P82980 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP5P82980 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP5P82980 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP5P82980 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBP5P82980 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP5P82980 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP5P82980 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP5P82980 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP5P82980 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP5P82980 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP5P82980 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP5P82980 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP5P82980 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP5P82980 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP5P82980 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP5P82980 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP5P82980 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP5P82980 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP5P82980 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP5P82980 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP5P82980 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP5P82980 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP5P82980 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP5P82980 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP5P82980 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP5P82980 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP5P82980 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RBP5P82980 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBP5P82980 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBP5P82980 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RBP5P82980 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBP5P82980 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBP5P82980 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RBP5P82980 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBP5P82980 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RBP5P82980 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RBP5P82980 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBP5P82980 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBP5P82980 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP5P82980 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP5P82980 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP5P82980 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP5P82980 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP5P82980 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP5P82980 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP5P82980 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP5P82980 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP5P82980 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBP5P82980 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBP5P82980 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBP5P82980 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBP5P82980 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBP5P82980 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBP5P82980 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBP5P82980 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP5P82980 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP5P82980 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP5P82980 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP5P82980 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP5P82980 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP5P82980 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP5P82980 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP5P82980 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP5P82980 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP5P82980 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP5P82980 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP5P82980 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP5P82980 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP5P82980 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP5P82980 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP5P82980 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP5P82980 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP5P82980 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP5P82980 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP5P82980 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP5P82980 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP5P82980 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP5P82980 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP5P82980 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP5P82980 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP5P82980 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP5P82980 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP5P82980 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP5P82980 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP5P82980 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBP5P82980 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBP5P82980 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBP5P82980 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBP5P82980 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBP5P82980 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBP5P82980 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBP5P82980 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms