Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TMF1P82094 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TMF1P82094 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TMF1P82094 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TMF1P82094 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TMF1P82094 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TMF1P82094 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TMF1P82094 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TMF1P82094 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TMF1P82094 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TMF1P82094 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TMF1P82094 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TMF1P82094 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TMF1P82094 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TMF1P82094 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TMF1P82094 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TMF1P82094 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TMF1P82094 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TMF1P82094 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TMF1P82094 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TMF1P82094 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TMF1P82094 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TMF1P82094 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TMF1P82094 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TMF1P82094 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
TMF1P82094 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TMF1P82094 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TMF1P82094 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TMF1P82094 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TMF1P82094 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TMF1P82094 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TMF1P82094 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TMF1P82094 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TMF1P82094 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TMF1P82094 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TMF1P82094 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TMF1P82094 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TMF1P82094 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TMF1P82094 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TMF1P82094 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TMF1P82094 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TMF1P82094 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TMF1P82094 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TMF1P82094 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TMF1P82094 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TMF1P82094 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TMF1P82094 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TMF1P82094 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TMF1P82094 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TMF1P82094 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TMF1P82094 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TMF1P82094 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TMF1P82094 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TMF1P82094 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TMF1P82094 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TMF1P82094 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TMF1P82094 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TMF1P82094 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TMF1P82094 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TMF1P82094 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TMF1P82094 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TMF1P82094 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TMF1P82094 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TMF1P82094 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TMF1P82094 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TMF1P82094 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TMF1P82094 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TMF1P82094 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TMF1P82094 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TMF1P82094 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TMF1P82094 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TMF1P82094 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TMF1P82094 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TMF1P82094 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TMF1P82094 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TMF1P82094 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TMF1P82094 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TMF1P82094 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TMF1P82094 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TMF1P82094 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TMF1P82094 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TMF1P82094 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TMF1P82094 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TMF1P82094 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TMF1P82094 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TMF1P82094 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TMF1P82094 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TMF1P82094 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TMF1P82094 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TMF1P82094 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TMF1P82094 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TMF1P82094 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TMF1P82094 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TMF1P82094 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TMF1P82094 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TMF1P82094 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TMF1P82094 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TMF1P82094 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TMF1P82094 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TMF1P82094 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms