Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HBA1P69905 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HBA1P69905 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HBA1P69905 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HBA1P69905 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HBA1P69905 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HBA1P69905 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HBA1P69905 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HBA1P69905 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HBA1P69905 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HBA1P69905 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HBA1P69905 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HBA1P69905 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HBA1P69905 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HBA1P69905 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HBA1P69905 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HBA1P69905 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HBA1P69905 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HBA1P69905 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HBA1P69905 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HBA1P69905 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HBA1P69905 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HBA1P69905 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HBA1P69905 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HBA1P69905 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HBA1P69905 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HBA1P69905 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HBA1P69905 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HBA1P69905 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HBA1P69905 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HBA1P69905 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HBA1P69905 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HBA1P69905 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HBA1P69905 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HBA1P69905 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBA1P69905 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBA1P69905 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBA1P69905 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBA1P69905 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBA1P69905 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBA1P69905 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBA1P69905 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBA1P69905 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBA1P69905 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBA1P69905 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBA1P69905 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBA1P69905 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBA1P69905 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HBA1P69905 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HBA1P69905 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HBA1P69905 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HBA1P69905 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HBA1P69905 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HBA1P69905 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HBA1P69905 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HBA1P69905 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HBA1P69905 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HBA1P69905 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HBA1P69905 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HBA1P69905 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HBA1P69905 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HBA1P69905 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HBA1P69905 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HBA1P69905 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HBA1P69905 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HBA1P69905 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HBA1P69905 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HBA1P69905 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HBA1P69905 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HBA1P69905 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HBA1P69905 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HBA1P69905 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HBA1P69905 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HBA1P69905 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HBA1P69905 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HBA1P69905 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HBA1P69905 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HBA1P69905 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HBA1P69905 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HBA1P69905 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HBA1P69905 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HBA1P69905 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HBA1P69905 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HBA1P69905 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HBA1P69905 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HBA1P69905 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HBA1P69905 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HBA1P69905 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HBA1P69905 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HBA1P69905 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HBA1P69905 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HBA1P69905 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HBA1P69905 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HBA1P69905 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HBA1P69905 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HBA1P69905 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HBA1P69905 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HBA1P69905 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HBA1P69905 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HBA1P69905 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms