Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBX1P62877 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBX1P62877 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBX1P62877 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBX1P62877 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBX1P62877 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBX1P62877 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBX1P62877 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBX1P62877 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBX1P62877 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBX1P62877 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBX1P62877 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBX1P62877 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBX1P62877 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBX1P62877 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBX1P62877 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBX1P62877 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBX1P62877 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBX1P62877 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBX1P62877 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBX1P62877 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBX1P62877 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBX1P62877 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBX1P62877 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBX1P62877 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBX1P62877 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBX1P62877 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBX1P62877 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBX1P62877 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBX1P62877 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBX1P62877 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBX1P62877 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBX1P62877 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBX1P62877 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBX1P62877 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBX1P62877 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBX1P62877 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBX1P62877 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBX1P62877 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBX1P62877 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBX1P62877 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBX1P62877 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBX1P62877 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBX1P62877 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBX1P62877 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBX1P62877 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBX1P62877 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBX1P62877 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBX1P62877 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBX1P62877 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBX1P62877 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBX1P62877 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBX1P62877 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBX1P62877 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBX1P62877 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBX1P62877 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBX1P62877 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBX1P62877 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBX1P62877 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBX1P62877 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBX1P62877 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms