Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVK-21P61565 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVK-21P61565 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-21P61565 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms