Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3EP60228 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms