Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCBP3P57721 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms