Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTSWP56202 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTSWP56202 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTSWP56202 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CTSWP56202 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTSWP56202 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTSWP56202 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTSWP56202 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTSWP56202 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTSWP56202 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTSWP56202 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTSWP56202 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTSWP56202 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTSWP56202 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTSWP56202 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTSWP56202 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTSWP56202 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTSWP56202 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTSWP56202 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTSWP56202 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CTSWP56202 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTSWP56202 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTSWP56202 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTSWP56202 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTSWP56202 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTSWP56202 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTSWP56202 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTSWP56202 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTSWP56202 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTSWP56202 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTSWP56202 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTSWP56202 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CTSWP56202 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTSWP56202 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTSWP56202 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTSWP56202 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSWP56202 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSWP56202 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSWP56202 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSWP56202 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSWP56202 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSWP56202 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSWP56202 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSWP56202 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSWP56202 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSWP56202 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSWP56202 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTSWP56202 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTSWP56202 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTSWP56202 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTSWP56202 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTSWP56202 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTSWP56202 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTSWP56202 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTSWP56202 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTSWP56202 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSWP56202 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSWP56202 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSWP56202 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSWP56202 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSWP56202 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSWP56202 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSWP56202 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSWP56202 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSWP56202 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSWP56202 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSWP56202 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSWP56202 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSWP56202 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTSWP56202 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTSWP56202 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTSWP56202 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTSWP56202 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTSWP56202 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTSWP56202 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTSWP56202 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTSWP56202 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTSWP56202 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTSWP56202 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTSWP56202 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTSWP56202 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTSWP56202 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTSWP56202 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTSWP56202 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTSWP56202 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CTSWP56202 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTSWP56202 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTSWP56202 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTSWP56202 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CTSWP56202 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTSWP56202 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTSWP56202 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTSWP56202 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTSWP56202 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTSWP56202 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTSWP56202 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTSWP56202 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTSWP56202 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTSWP56202 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CTSWP56202 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms