Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OXCT1P55809 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OXCT1P55809 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OXCT1P55809 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OXCT1P55809 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OXCT1P55809 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OXCT1P55809 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms