Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HADHBP55084 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HADHBP55084 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HADHBP55084 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HADHBP55084 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HADHBP55084 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HADHBP55084 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HADHBP55084 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HADHBP55084 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HADHBP55084 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HADHBP55084 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HADHBP55084 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HADHBP55084 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HADHBP55084 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HADHBP55084 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HADHBP55084 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HADHBP55084 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HADHBP55084 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HADHBP55084 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HADHBP55084 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HADHBP55084 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HADHBP55084 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HADHBP55084 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HADHBP55084 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HADHBP55084 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HADHBP55084 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HADHBP55084 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HADHBP55084 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HADHBP55084 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HADHBP55084 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HADHBP55084 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HADHBP55084 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HADHBP55084 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HADHBP55084 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HADHBP55084 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HADHBP55084 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HADHBP55084 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HADHBP55084 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HADHBP55084 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HADHBP55084 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HADHBP55084 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HADHBP55084 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HADHBP55084 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HADHBP55084 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HADHBP55084 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HADHBP55084 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HADHBP55084 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HADHBP55084 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HADHBP55084 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HADHBP55084 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HADHBP55084 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HADHBP55084 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HADHBP55084 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HADHBP55084 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HADHBP55084 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HADHBP55084 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HADHBP55084 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HADHBP55084 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HADHBP55084 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HADHBP55084 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HADHBP55084 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HADHBP55084 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HADHBP55084 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HADHBP55084 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HADHBP55084 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HADHBP55084 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HADHBP55084 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HADHBP55084 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HADHBP55084 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HADHBP55084 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HADHBP55084 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HADHBP55084 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HADHBP55084 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HADHBP55084 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HADHBP55084 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHBP55084 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHBP55084 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHBP55084 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHBP55084 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHBP55084 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHBP55084 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHBP55084 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HADHBP55084 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HADHBP55084 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HADHBP55084 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HADHBP55084 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HADHBP55084 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HADHBP55084 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HADHBP55084 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HADHBP55084 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HADHBP55084 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HADHBP55084 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HADHBP55084 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HADHBP55084 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HADHBP55084 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HADHBP55084 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HADHBP55084 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HADHBP55084 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HADHBP55084 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HADHBP55084 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms