Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMP55040 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMP55040 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMP55040 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMP55040 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMP55040 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMP55040 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEMP55040 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMP55040 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMP55040 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMP55040 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMP55040 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMP55040 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMP55040 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMP55040 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMP55040 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMP55040 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMP55040 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMP55040 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMP55040 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMP55040 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEMP55040 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEMP55040 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEMP55040 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEMP55040 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEMP55040 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEMP55040 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMP55040 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMP55040 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMP55040 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMP55040 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMP55040 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMP55040 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMP55040 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMP55040 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMP55040 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMP55040 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMP55040 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMP55040 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMP55040 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMP55040 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GEMP55040 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GEMP55040 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEMP55040 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMP55040 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMP55040 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMP55040 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMP55040 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMP55040 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMP55040 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMP55040 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMP55040 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMP55040 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMP55040 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMP55040 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMP55040 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMP55040 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMP55040 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMP55040 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMP55040 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMP55040 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMP55040 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMP55040 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMP55040 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMP55040 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMP55040 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMP55040 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMP55040 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMP55040 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMP55040 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMP55040 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMP55040 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMP55040 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMP55040 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMP55040 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMP55040 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMP55040 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMP55040 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMP55040 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMP55040 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMP55040 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMP55040 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMP55040 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEMP55040 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEMP55040 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GEMP55040 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEMP55040 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEMP55040 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEMP55040 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEMP55040 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GEMP55040 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEMP55040 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEMP55040 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GEMP55040 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GEMP55040 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEMP55040 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEMP55040 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEMP55040 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEMP55040 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEMP55040 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms