Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD4P55036 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD4P55036 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD4P55036 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD4P55036 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD4P55036 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD4P55036 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD4P55036 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD4P55036 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD4P55036 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSMD4P55036 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD4P55036 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms