Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHA4P54764 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHA4P54764 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms