Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLCNKBP51801 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCNKBP51801 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCNKBP51801 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms