Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IDH3AP50213 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms