Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 CCDC144NL-AS1-218ENST00000583962 3352 ntTSL 1 (best)12.18□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 51.5
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AARSP49588 CCDC144NL-AS1-215ENST00000582324 756 ntTSL 311.84□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 51.5
AARSP49588 RETSAT-201ENST00000295802 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.662e-9■■■■■ 51.5
AARSP49588 CCDC144NL-AS1-201ENST00000417232 709 ntTSL 36□□□□□ -1.452e-9■■■■■ 51.5
AARSP49588 CCNY-206ENST00000470025 346 ntTSL 54.43□□□□□ -1.72e-6■■■■■ 51.5
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AARSP49588 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 51.2
AARSP49588 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 51.2
AARSP49588 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 51.2
AARSP49588 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 51.2
AARSP49588 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 51.2
AARSP49588 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.886e-7■■■■■ 51.1
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AARSP49588 DHRS3-202ENST00000464917 539 ntTSL 314.35□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 51.1
AARSP49588 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 50.9
AARSP49588 FANCD2-204ENST00000421731 3425 ntTSL 1 (best)4.66□□□□□ -1.668e-7■■■■■ 50.9
AARSP49588 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 50.6
AARSP49588 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 50.6
AARSP49588 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 50.6
AARSP49588 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 50.6
AARSP49588 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.822e-11■■■■■ 50.2
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AARSP49588 NSMAF-201ENST00000038176 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.782e-11■■■■■ 50.2
AARSP49588 NSMAF-211ENST00000521712 539 ntTSL 28.06□□□□□ -1.122e-11■■■■■ 50.2
AARSP49588 NSMAF-203ENST00000517612 679 ntTSL 54.71□□□□□ -1.662e-11■■■■■ 50.2
AARSP49588 GAK-219ENST00000512325 577 ntTSL 322.89■■□□□ 1.255e-7■■■■■ 50.2
AARSP49588 GAK-209ENST00000507580 468 ntTSL 422.89■■□□□ 1.255e-7■■■■■ 50.2
AARSP49588 GAK-207ENST00000505819 1326 ntTSL 522.62■■□□□ 1.215e-7■■■■■ 50.2
AARSP49588 GAK-202ENST00000502656 554 ntTSL 421.12■□□□□ 0.975e-7■■■■■ 50.2
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AARSP49588 C1orf159-213ENST00000472741 661 ntTSL 419.61■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 50.2
AARSP49588 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 50.2
AARSP49588 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 50.2
AARSP49588 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 518.96■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 50.2
AARSP49588 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.9■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 50.2
AARSP49588 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 217.52■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 50.2
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AARSP49588 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.86■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 50.2
AARSP49588 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 215.21■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 50.2
AARSP49588 GAK-212ENST00000510022 618 ntTSL 410.49□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 50.2
AARSP49588 GAK-215ENST00000511229 568 ntTSL 36.79□□□□□ -1.325e-7■■■■■ 50.2
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AARSP49588 AL669831.3-207ENST00000635509 941 ntTSL 59.58□□□□□ -0.886e-7■■■■■ 50.2
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AARSP49588 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 49.9
AARSP49588 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.385e-6■■■■■ 49.9
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AARSP49588 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 49.9
AARSP49588 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 48.9
AARSP49588 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 48.9
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AARSP49588 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 48.7
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AARSP49588 GRB10-210ENST00000407526 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 48.6
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AARSP49588 GRB10-204ENST00000398812 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 48.6
AARSP49588 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -11e-6■■■■■ 48.6
AARSP49588 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 22e-6■■■■■ 48.4
AARSP49588 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.962e-6■■■■■ 48.4
AARSP49588 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.792e-6■■■■■ 48.4
AARSP49588 EIF5A-209ENST00000573714 602 ntTSL 322.63■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 48.4
AARSP49588 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 48.4
AARSP49588 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 48.4
AARSP49588 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 48.4
AARSP49588 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 48.4
AARSP49588 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 48.4
AARSP49588 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.083e-6■■■■■ 48.2
AARSP49588 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 48.2
AARSP49588 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 48.2
AARSP49588 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 48.2
AARSP49588 ARHGAP22-209ENST00000471013 690 ntTSL 319.27■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 48.2
AARSP49588 ARHGAP22-207ENST00000460425 2764 ntTSL 218.83■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 48.2
AARSP49588 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 48.2
AARSP49588 BCR-214ENST00000487679 231 ntTSL 1 (best)9.01□□□□□ -0.973e-6■■■■■ 48.1
AARSP49588 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 48.1
AARSP49588 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.275e-6■■■■■ 48
AARSP49588 DNTTIP1-205ENST00000456939 1073 ntTSL 522.24■■□□□ 1.154e-6■■■■■ 48
AARSP49588 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.089e-10■■■■■ 48
AARSP49588 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.024e-6■■■■■ 48
AARSP49588 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.852e-7■■■■■ 48
AARSP49588 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.79e-10■■■■■ 48
AARSP49588 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.389e-10■■■■■ 48
AARSP49588 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.355e-6■■■■■ 48
AARSP49588 ACTN4-211ENST00000589528 441 ntTSL 216.52■□□□□ 0.249e-10■■■■■ 48
AARSP49588 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.129e-10■■■■■ 48
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