Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNI2P48788 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNI2P48788 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNI2P48788 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNI2P48788 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNI2P48788 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNI2P48788 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNI2P48788 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNI2P48788 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNNI2P48788 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNI2P48788 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNNI2P48788 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNI2P48788 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNI2P48788 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNI2P48788 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNI2P48788 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNI2P48788 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNI2P48788 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TNNI2P48788 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNI2P48788 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNI2P48788 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNI2P48788 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNI2P48788 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNNI2P48788 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNI2P48788 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNI2P48788 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNI2P48788 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNI2P48788 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNI2P48788 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNI2P48788 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNI2P48788 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNI2P48788 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNI2P48788 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNNI2P48788 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNI2P48788 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNNI2P48788 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNNI2P48788 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNNI2P48788 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNNI2P48788 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI2P48788 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI2P48788 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI2P48788 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI2P48788 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNNI2P48788 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNNI2P48788 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNNI2P48788 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI2P48788 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNI2P48788 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TNNI2P48788 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNI2P48788 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms