Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF4P48230 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF4P48230 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms