Protein–RNA interactions for Protein: P40123

CAP2, Adenylyl cyclase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP2P40123 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAP2P40123 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP2P40123 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP2P40123 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP2P40123 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP2P40123 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP2P40123 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAP2P40123 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAP2P40123 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAP2P40123 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAP2P40123 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAP2P40123 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CAP2P40123 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAP2P40123 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAP2P40123 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CAP2P40123 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAP2P40123 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CAP2P40123 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAP2P40123 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CAP2P40123 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAP2P40123 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAP2P40123 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAP2P40123 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAP2P40123 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAP2P40123 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAP2P40123 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAP2P40123 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAP2P40123 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CAP2P40123 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAP2P40123 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CAP2P40123 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAP2P40123 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAP2P40123 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAP2P40123 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAP2P40123 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAP2P40123 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAP2P40123 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CAP2P40123 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAP2P40123 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAP2P40123 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAP2P40123 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAP2P40123 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAP2P40123 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAP2P40123 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAP2P40123 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAP2P40123 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAP2P40123 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAP2P40123 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAP2P40123 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAP2P40123 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAP2P40123 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAP2P40123 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAP2P40123 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAP2P40123 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAP2P40123 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAP2P40123 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAP2P40123 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAP2P40123 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CAP2P40123 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAP2P40123 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAP2P40123 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAP2P40123 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAP2P40123 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAP2P40123 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAP2P40123 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAP2P40123 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAP2P40123 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP2P40123 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP2P40123 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP2P40123 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP2P40123 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP2P40123 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP2P40123 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP2P40123 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP2P40123 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP2P40123 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP2P40123 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAP2P40123 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAP2P40123 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAP2P40123 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAP2P40123 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAP2P40123 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAP2P40123 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAP2P40123 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAP2P40123 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAP2P40123 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CAP2P40123 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAP2P40123 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAP2P40123 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAP2P40123 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAP2P40123 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAP2P40123 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CAP2P40123 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAP2P40123 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAP2P40123 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAP2P40123 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CAP2P40123 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CAP2P40123 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAP2P40123 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAP2P40123 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms