Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKAP35790 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKAP35790 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKAP35790 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKAP35790 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKAP35790 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHKAP35790 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHKAP35790 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHKAP35790 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHKAP35790 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHKAP35790 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHKAP35790 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHKAP35790 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHKAP35790 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHKAP35790 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKAP35790 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKAP35790 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKAP35790 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKAP35790 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKAP35790 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKAP35790 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKAP35790 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKAP35790 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHKAP35790 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKAP35790 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKAP35790 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKAP35790 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKAP35790 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKAP35790 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKAP35790 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKAP35790 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKAP35790 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKAP35790 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKAP35790 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHKAP35790 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHKAP35790 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHKAP35790 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHKAP35790 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHKAP35790 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHKAP35790 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHKAP35790 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHKAP35790 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHKAP35790 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHKAP35790 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHKAP35790 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHKAP35790 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHKAP35790 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHKAP35790 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHKAP35790 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHKAP35790 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHKAP35790 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKAP35790 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKAP35790 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKAP35790 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKAP35790 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHKAP35790 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKAP35790 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKAP35790 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKAP35790 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKAP35790 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKAP35790 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKAP35790 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKAP35790 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKAP35790 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKAP35790 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKAP35790 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKAP35790 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKAP35790 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHKAP35790 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHKAP35790 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHKAP35790 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHKAP35790 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHKAP35790 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHKAP35790 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHKAP35790 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHKAP35790 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHKAP35790 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHKAP35790 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHKAP35790 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHKAP35790 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHKAP35790 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHKAP35790 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHKAP35790 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHKAP35790 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHKAP35790 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHKAP35790 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHKAP35790 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHKAP35790 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHKAP35790 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHKAP35790 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKAP35790 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKAP35790 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKAP35790 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKAP35790 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKAP35790 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKAP35790 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKAP35790 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKAP35790 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKAP35790 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHKAP35790 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms