Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTF4P34130 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTF4P34130 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NTF4P34130 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NTF4P34130 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTF4P34130 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTF4P34130 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTF4P34130 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTF4P34130 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTF4P34130 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTF4P34130 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NTF4P34130 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTF4P34130 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTF4P34130 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTF4P34130 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF4P34130 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF4P34130 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF4P34130 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF4P34130 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF4P34130 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF4P34130 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF4P34130 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF4P34130 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF4P34130 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF4P34130 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF4P34130 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTF4P34130 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTF4P34130 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTF4P34130 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTF4P34130 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTF4P34130 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTF4P34130 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTF4P34130 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTF4P34130 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTF4P34130 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTF4P34130 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTF4P34130 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTF4P34130 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTF4P34130 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTF4P34130 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTF4P34130 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTF4P34130 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTF4P34130 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NTF4P34130 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTF4P34130 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTF4P34130 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTF4P34130 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTF4P34130 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTF4P34130 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NTF4P34130 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTF4P34130 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTF4P34130 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NTF4P34130 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTF4P34130 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTF4P34130 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTF4P34130 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NTF4P34130 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTF4P34130 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTF4P34130 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTF4P34130 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTF4P34130 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTF4P34130 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTF4P34130 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTF4P34130 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NTF4P34130 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTF4P34130 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NTF4P34130 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF4P34130 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF4P34130 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF4P34130 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF4P34130 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF4P34130 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF4P34130 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF4P34130 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF4P34130 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF4P34130 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF4P34130 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF4P34130 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF4P34130 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NTF4P34130 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NTF4P34130 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NTF4P34130 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms