Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GDI1P31150 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDI1P31150 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDI1P31150 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDI1P31150 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDI1P31150 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDI1P31150 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDI1P31150 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDI1P31150 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDI1P31150 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GDI1P31150 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDI1P31150 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDI1P31150 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GDI1P31150 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GDI1P31150 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GDI1P31150 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GDI1P31150 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDI1P31150 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDI1P31150 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDI1P31150 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDI1P31150 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDI1P31150 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDI1P31150 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDI1P31150 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDI1P31150 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDI1P31150 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDI1P31150 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDI1P31150 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDI1P31150 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDI1P31150 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDI1P31150 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDI1P31150 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDI1P31150 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDI1P31150 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GDI1P31150 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDI1P31150 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDI1P31150 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDI1P31150 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDI1P31150 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDI1P31150 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDI1P31150 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDI1P31150 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDI1P31150 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDI1P31150 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDI1P31150 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDI1P31150 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDI1P31150 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDI1P31150 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDI1P31150 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDI1P31150 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDI1P31150 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDI1P31150 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDI1P31150 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDI1P31150 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDI1P31150 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDI1P31150 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GDI1P31150 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GDI1P31150 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GDI1P31150 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GDI1P31150 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDI1P31150 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDI1P31150 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDI1P31150 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDI1P31150 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDI1P31150 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDI1P31150 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDI1P31150 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDI1P31150 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDI1P31150 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDI1P31150 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDI1P31150 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDI1P31150 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDI1P31150 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDI1P31150 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GDI1P31150 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDI1P31150 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDI1P31150 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDI1P31150 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GDI1P31150 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDI1P31150 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDI1P31150 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDI1P31150 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDI1P31150 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDI1P31150 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDI1P31150 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDI1P31150 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GDI1P31150 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDI1P31150 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDI1P31150 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDI1P31150 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDI1P31150 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDI1P31150 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDI1P31150 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDI1P31150 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDI1P31150 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDI1P31150 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDI1P31150 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDI1P31150 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GDI1P31150 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDI1P31150 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms