Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CLIP1P30622 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms