Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CRABP1P29762 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRABP1P29762 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRABP1P29762 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRABP1P29762 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms