Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRMP28827 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRMP28827 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
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