Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBL1P28749 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBL1P28749 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBL1P28749 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBL1P28749 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBL1P28749 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBL1P28749 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBL1P28749 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBL1P28749 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBL1P28749 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBL1P28749 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBL1P28749 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBL1P28749 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBL1P28749 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBL1P28749 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBL1P28749 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBL1P28749 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBL1P28749 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBL1P28749 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBL1P28749 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBL1P28749 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBL1P28749 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBL1P28749 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RBL1P28749 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RBL1P28749 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBL1P28749 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBL1P28749 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBL1P28749 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBL1P28749 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBL1P28749 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBL1P28749 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBL1P28749 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBL1P28749 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBL1P28749 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBL1P28749 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBL1P28749 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBL1P28749 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBL1P28749 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBL1P28749 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBL1P28749 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBL1P28749 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBL1P28749 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL1P28749 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL1P28749 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL1P28749 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL1P28749 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL1P28749 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL1P28749 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL1P28749 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL1P28749 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL1P28749 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL1P28749 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL1P28749 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL1P28749 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL1P28749 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL1P28749 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL1P28749 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL1P28749 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL1P28749 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL1P28749 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBL1P28749 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBL1P28749 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBL1P28749 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBL1P28749 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL1P28749 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL1P28749 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL1P28749 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL1P28749 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL1P28749 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL1P28749 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL1P28749 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL1P28749 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL1P28749 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL1P28749 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL1P28749 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL1P28749 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL1P28749 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL1P28749 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL1P28749 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL1P28749 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL1P28749 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL1P28749 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL1P28749 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL1P28749 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL1P28749 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL1P28749 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL1P28749 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL1P28749 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL1P28749 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL1P28749 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL1P28749 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL1P28749 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL1P28749 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL1P28749 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL1P28749 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL1P28749 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL1P28749 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL1P28749 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL1P28749 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL1P28749 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms