Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPA1P27694 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPA1P27694 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPA1P27694 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPA1P27694 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPA1P27694 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPA1P27694 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPA1P27694 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA1P27694 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA1P27694 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA1P27694 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA1P27694 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA1P27694 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA1P27694 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA1P27694 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA1P27694 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA1P27694 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA1P27694 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA1P27694 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA1P27694 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA1P27694 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA1P27694 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA1P27694 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA1P27694 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA1P27694 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA1P27694 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA1P27694 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA1P27694 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA1P27694 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA1P27694 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA1P27694 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA1P27694 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA1P27694 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPA1P27694 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPA1P27694 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPA1P27694 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPA1P27694 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPA1P27694 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPA1P27694 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RPA1P27694 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPA1P27694 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPA1P27694 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPA1P27694 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPA1P27694 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPA1P27694 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPA1P27694 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPA1P27694 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPA1P27694 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RPA1P27694 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RPA1P27694 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPA1P27694 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RPA1P27694 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPA1P27694 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPA1P27694 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPA1P27694 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPA1P27694 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPA1P27694 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPA1P27694 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPA1P27694 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPA1P27694 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPA1P27694 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPA1P27694 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPA1P27694 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPA1P27694 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPA1P27694 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPA1P27694 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPA1P27694 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPA1P27694 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RPA1P27694 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RPA1P27694 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPA1P27694 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPA1P27694 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPA1P27694 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RPA1P27694 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPA1P27694 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPA1P27694 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPA1P27694 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPA1P27694 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPA1P27694 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPA1P27694 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPA1P27694 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPA1P27694 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPA1P27694 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPA1P27694 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPA1P27694 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPA1P27694 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPA1P27694 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPA1P27694 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPA1P27694 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPA1P27694 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPA1P27694 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPA1P27694 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPA1P27694 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPA1P27694 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RPA1P27694 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPA1P27694 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPA1P27694 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPA1P27694 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPA1P27694 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPA1P27694 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms