Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL13P26373 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL13P26373 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL13P26373 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL13P26373 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL13P26373 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL13P26373 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL13P26373 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL13P26373 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL13P26373 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL13P26373 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL13P26373 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL13P26373 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL13P26373 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL13P26373 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL13P26373 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL13P26373 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL13P26373 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL13P26373 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL13P26373 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL13P26373 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL13P26373 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL13P26373 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL13P26373 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL13P26373 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL13P26373 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL13P26373 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL13P26373 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL13P26373 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL13P26373 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL13P26373 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL13P26373 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL13P26373 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL13P26373 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL13P26373 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL13P26373 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL13P26373 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL13P26373 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL13P26373 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL13P26373 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL13P26373 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL13P26373 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL13P26373 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL13P26373 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL13P26373 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL13P26373 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL13P26373 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL13P26373 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL13P26373 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL13P26373 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL13P26373 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL13P26373 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL13P26373 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL13P26373 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL13P26373 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL13P26373 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL13P26373 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL13P26373 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL13P26373 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL13P26373 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL13P26373 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL13P26373 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL13P26373 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL13P26373 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL13P26373 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL13P26373 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL13P26373 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL13P26373 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL13P26373 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL13P26373 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL13P26373 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL13P26373 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL13P26373 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL13P26373 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL13P26373 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL13P26373 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL13P26373 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL13P26373 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL13P26373 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL13P26373 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL13P26373 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL13P26373 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL13P26373 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL13P26373 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms