Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA3P26006 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA3P26006 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms