Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM3P25205 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM3P25205 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3P25205 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3P25205 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3P25205 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3P25205 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3P25205 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3P25205 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3P25205 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3P25205 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3P25205 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM3P25205 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3P25205 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3P25205 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3P25205 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3P25205 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3P25205 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3P25205 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3P25205 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3P25205 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3P25205 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3P25205 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3P25205 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3P25205 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3P25205 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM3P25205 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3P25205 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3P25205 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3P25205 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3P25205 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3P25205 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3P25205 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM3P25205 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3P25205 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3P25205 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3P25205 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM3P25205 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3P25205 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3P25205 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3P25205 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3P25205 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3P25205 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3P25205 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3P25205 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3P25205 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3P25205 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3P25205 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM3P25205 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3P25205 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3P25205 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3P25205 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3P25205 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3P25205 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM3P25205 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3P25205 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3P25205 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3P25205 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3P25205 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3P25205 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3P25205 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3P25205 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3P25205 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3P25205 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3P25205 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3P25205 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3P25205 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM3P25205 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM3P25205 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM3P25205 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM3P25205 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCM3P25205 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCM3P25205 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCM3P25205 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM3P25205 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM3P25205 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM3P25205 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM3P25205 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM3P25205 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM3P25205 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM3P25205 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM3P25205 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM3P25205 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM3P25205 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM3P25205 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM3P25205 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM3P25205 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM3P25205 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM3P25205 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM3P25205 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM3P25205 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM3P25205 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM3P25205 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM3P25205 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM3P25205 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM3P25205 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM3P25205 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM3P25205 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM3P25205 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM3P25205 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms