Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNE1P24864 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNE1P24864 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE1P24864 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms