Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRM1P23921 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRM1P23921 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRM1P23921 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRM1P23921 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRM1P23921 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRM1P23921 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRM1P23921 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRM1P23921 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRM1P23921 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM1P23921 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM1P23921 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM1P23921 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM1P23921 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM1P23921 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM1P23921 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM1P23921 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM1P23921 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM1P23921 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM1P23921 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM1P23921 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM1P23921 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM1P23921 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRM1P23921 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRM1P23921 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRM1P23921 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRM1P23921 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRM1P23921 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRM1P23921 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRM1P23921 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRM1P23921 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RRM1P23921 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRM1P23921 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRM1P23921 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRM1P23921 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRM1P23921 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRM1P23921 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RRM1P23921 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRM1P23921 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RRM1P23921 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RRM1P23921 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRM1P23921 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRM1P23921 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRM1P23921 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRM1P23921 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRM1P23921 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRM1P23921 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRM1P23921 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRM1P23921 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRM1P23921 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRM1P23921 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRM1P23921 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RRM1P23921 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRM1P23921 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRM1P23921 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRM1P23921 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRM1P23921 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRM1P23921 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRM1P23921 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRM1P23921 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRM1P23921 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRM1P23921 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRM1P23921 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRM1P23921 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRM1P23921 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRM1P23921 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRM1P23921 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRM1P23921 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRM1P23921 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRM1P23921 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRM1P23921 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRM1P23921 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRM1P23921 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRM1P23921 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRM1P23921 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRM1P23921 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRM1P23921 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRM1P23921 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRM1P23921 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRM1P23921 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRM1P23921 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRM1P23921 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRM1P23921 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRM1P23921 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRM1P23921 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRM1P23921 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRM1P23921 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RRM1P23921 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRM1P23921 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRM1P23921 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRM1P23921 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRM1P23921 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRM1P23921 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRM1P23921 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRM1P23921 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRM1P23921 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRM1P23921 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRM1P23921 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRM1P23921 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRM1P23921 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms