Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRDP23468 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRDP23468 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRDP23468 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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