Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF6P23409 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF6P23409 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF6P23409 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF6P23409 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF6P23409 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF6P23409 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYF6P23409 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF6P23409 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF6P23409 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF6P23409 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF6P23409 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF6P23409 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF6P23409 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF6P23409 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF6P23409 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYF6P23409 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF6P23409 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF6P23409 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF6P23409 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF6P23409 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF6P23409 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF6P23409 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF6P23409 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF6P23409 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF6P23409 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF6P23409 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF6P23409 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYF6P23409 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF6P23409 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF6P23409 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF6P23409 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF6P23409 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF6P23409 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF6P23409 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MYF6P23409 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF6P23409 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF6P23409 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF6P23409 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF6P23409 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF6P23409 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF6P23409 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF6P23409 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF6P23409 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF6P23409 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF6P23409 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF6P23409 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF6P23409 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MYF6P23409 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF6P23409 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF6P23409 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF6P23409 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF6P23409 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF6P23409 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF6P23409 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF6P23409 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF6P23409 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF6P23409 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MYF6P23409 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MYF6P23409 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYF6P23409 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYF6P23409 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYF6P23409 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYF6P23409 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYF6P23409 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYF6P23409 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYF6P23409 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYF6P23409 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYF6P23409 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MYF6P23409 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYF6P23409 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYF6P23409 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYF6P23409 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYF6P23409 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MYF6P23409 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYF6P23409 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYF6P23409 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYF6P23409 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MYF6P23409 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYF6P23409 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYF6P23409 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYF6P23409 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYF6P23409 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYF6P23409 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYF6P23409 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYF6P23409 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYF6P23409 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYF6P23409 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MYF6P23409 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYF6P23409 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYF6P23409 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYF6P23409 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MYF6P23409 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYF6P23409 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYF6P23409 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYF6P23409 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYF6P23409 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYF6P23409 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYF6P23409 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MYF6P23409 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms