Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDCP19113 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDCP19113 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDCP19113 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDCP19113 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDCP19113 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDCP19113 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDCP19113 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDCP19113 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDCP19113 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDCP19113 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDCP19113 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDCP19113 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDCP19113 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDCP19113 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDCP19113 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDCP19113 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDCP19113 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDCP19113 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDCP19113 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDCP19113 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HDCP19113 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDCP19113 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HDCP19113 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDCP19113 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDCP19113 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDCP19113 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDCP19113 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDCP19113 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDCP19113 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDCP19113 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDCP19113 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDCP19113 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDCP19113 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDCP19113 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDCP19113 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDCP19113 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDCP19113 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDCP19113 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDCP19113 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDCP19113 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDCP19113 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDCP19113 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDCP19113 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDCP19113 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDCP19113 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDCP19113 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDCP19113 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDCP19113 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDCP19113 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDCP19113 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDCP19113 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDCP19113 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HDCP19113 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HDCP19113 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDCP19113 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDCP19113 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDCP19113 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDCP19113 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDCP19113 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDCP19113 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HDCP19113 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDCP19113 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDCP19113 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDCP19113 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDCP19113 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDCP19113 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDCP19113 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDCP19113 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDCP19113 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDCP19113 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDCP19113 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDCP19113 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDCP19113 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDCP19113 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDCP19113 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDCP19113 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDCP19113 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDCP19113 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDCP19113 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDCP19113 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDCP19113 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDCP19113 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDCP19113 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDCP19113 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDCP19113 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDCP19113 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDCP19113 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDCP19113 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDCP19113 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDCP19113 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDCP19113 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDCP19113 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDCP19113 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDCP19113 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDCP19113 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDCP19113 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDCP19113 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDCP19113 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDCP19113 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms