Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
UBTFP17480 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
UBTFP17480 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
UBTFP17480 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
UBTFP17480 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
UBTFP17480 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
UBTFP17480 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
UBTFP17480 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
UBTFP17480 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
UBTFP17480 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
UBTFP17480 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
UBTFP17480 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
UBTFP17480 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
UBTFP17480 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
UBTFP17480 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
UBTFP17480 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
UBTFP17480 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
UBTFP17480 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
UBTFP17480 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
UBTFP17480 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
UBTFP17480 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
UBTFP17480 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
UBTFP17480 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
UBTFP17480 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
UBTFP17480 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
UBTFP17480 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
UBTFP17480 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
UBTFP17480 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
UBTFP17480 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
UBTFP17480 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
UBTFP17480 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
UBTFP17480 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
UBTFP17480 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
UBTFP17480 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
UBTFP17480 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
UBTFP17480 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
UBTFP17480 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
UBTFP17480 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
UBTFP17480 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
UBTFP17480 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
UBTFP17480 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
UBTFP17480 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
UBTFP17480 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
UBTFP17480 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
UBTFP17480 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
UBTFP17480 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
UBTFP17480 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
UBTFP17480 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
UBTFP17480 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
UBTFP17480 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
UBTFP17480 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
UBTFP17480 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
UBTFP17480 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
UBTFP17480 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
UBTFP17480 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
UBTFP17480 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
UBTFP17480 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.49■■■■□ 3.59
UBTFP17480 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
UBTFP17480 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
UBTFP17480 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
UBTFP17480 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
UBTFP17480 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
UBTFP17480 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
UBTFP17480 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
UBTFP17480 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
UBTFP17480 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
UBTFP17480 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
UBTFP17480 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
UBTFP17480 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
UBTFP17480 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
UBTFP17480 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
UBTFP17480 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
UBTFP17480 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
UBTFP17480 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
UBTFP17480 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
UBTFP17480 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
UBTFP17480 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
UBTFP17480 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
UBTFP17480 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
UBTFP17480 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
UBTFP17480 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
UBTFP17480 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
UBTFP17480 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
UBTFP17480 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
UBTFP17480 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
UBTFP17480 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
UBTFP17480 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
UBTFP17480 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
UBTFP17480 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
UBTFP17480 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
UBTFP17480 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
UBTFP17480 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
UBTFP17480 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
UBTFP17480 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
UBTFP17480 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
UBTFP17480 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
UBTFP17480 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
UBTFP17480 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
UBTFP17480 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
UBTFP17480 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms