Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTLA4P16410 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTLA4P16410 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms