Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB3P14651 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms