Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLS3P13797 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLS3P13797 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS3P13797 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS3P13797 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS3P13797 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PLS3P13797 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS3P13797 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS3P13797 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS3P13797 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS3P13797 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS3P13797 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS3P13797 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS3P13797 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS3P13797 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLS3P13797 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLS3P13797 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLS3P13797 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLS3P13797 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLS3P13797 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLS3P13797 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS3P13797 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS3P13797 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS3P13797 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS3P13797 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS3P13797 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS3P13797 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS3P13797 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS3P13797 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS3P13797 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS3P13797 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS3P13797 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLS3P13797 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS3P13797 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS3P13797 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS3P13797 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS3P13797 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS3P13797 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS3P13797 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS3P13797 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS3P13797 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLS3P13797 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS3P13797 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS3P13797 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS3P13797 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS3P13797 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS3P13797 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS3P13797 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS3P13797 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS3P13797 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS3P13797 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS3P13797 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS3P13797 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS3P13797 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS3P13797 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS3P13797 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLS3P13797 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS3P13797 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS3P13797 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS3P13797 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS3P13797 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS3P13797 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS3P13797 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS3P13797 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS3P13797 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS3P13797 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PLS3P13797 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLS3P13797 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLS3P13797 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLS3P13797 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PLS3P13797 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLS3P13797 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PLS3P13797 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLS3P13797 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PLS3P13797 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLS3P13797 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLS3P13797 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLS3P13797 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLS3P13797 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLS3P13797 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PLS3P13797 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLS3P13797 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLS3P13797 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLS3P13797 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLS3P13797 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLS3P13797 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLS3P13797 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLS3P13797 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLS3P13797 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLS3P13797 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLS3P13797 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLS3P13797 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLS3P13797 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLS3P13797 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLS3P13797 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLS3P13797 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms